وصل ساتوشي وبيكاتشو إلى مدينة لوميوز في منطقة كالوس الشهيرة لاصطياد المزيد من البوكيمونات ومواصلة رحلتهما نحو أن يصبحا الأفضل. في هذه الأثناء، يتجول المخترع العبقري سيترون وشقيقته الصغيرة يوريكا في المدينة، فيصادفان ساتوشي الذي يتحدىهما على الفور في معركة. لكن سرعان ما يجدان نفسيهما متورطين في حادثة خطيرة عندما يتسبب فريق روكيت، الذي يلاحق ساتوشي إلى كالوس، في هجوم عنيف من غابورياس في المدينة. في بلدة فانيفيل الهادئة، تتدرب فتاة صغيرة تُدعى سيرينا يوميًا على ركوب سيهورن بناءً على طلب والدتها، وهي متسابقة سيهورن محترفة. بعد التدريب، تشاهد الأحداث الجارية في مدينة مياري على التلفاز، حيث تتعرف على فتى من طفولتها. ولأنه ترك أثرًا كبيرًا في حياتها، فإن رؤيته تُثير فيها رغبة جامحة في لقائه مجددًا؛ لذا، تنطلق سيرينا إلى مدينة مياري، عازمة على العثور على فتى ماضيها. تتبع سلسلة بوكيمون XY رحلة المجموعة عبر منطقة كالوس سعياً وراء طموحاتهم، حيث يتحدى ساتوشي صالات البوكيمون، ويتعلم سيترون من ساتوشي، بينما تبحث سيرينا عن حلمها الحقيقي. وفي خضم هذه الرحلة، يلتقون بأصدقاء جدد، ويواجهون منافسين جدد، ويواصلون إحباط مخططات فريق روكيت، ويكتشفون في الوقت نفسه بعض أسرار التطور الضخم.