يسقط مذنب غريب على الارض فيحدث تدميرا رهيبا ويتضح أنه بوكيمون يدعى ديوكسيس وفي الوقت نفسة ساتوشي رفقة الأصدقاء كانوا في طريقهم إلى مدينة لاروسي التي سقط فيها المذنب يلتقي ساتوشي بفتى يدعى تووي والذي يعاني من رهاب البوكيمونات بسبب حادثة وقعت له قبل أربع سنوات. ديوكسيس يقدم على وضع حاجز حول المدينة وأختطاف الناس لأسباب مجهولة ويبدأ ديوكسيس في معركة قتالية ضد بوكيمون يدعى ريكوازا الذي يعيش في الغلاف الجوي.